1.温州医科大学附属第一医院 药学部，浙江 温州 325015；2.温州医科大学 药学院，浙江 温州 325035
Theoretical study on the structure and properties of Remdesivir and its synthetic intermediates
CHEN Mengyi1, 2 , SUN Xiang1, 2 , HUANG Luoyi2 , WANG Chaojie2
1.Department of Pharmacy, the First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou 325015, China; 2.School of Pharmaceutical Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou 325035, China
引用本文:
陈蒙仪,孙祥,黄罗仪,等. null[J]. 温州医科大学学报, 2021, 51(9): 689-698.
Cite this article:
CHEN Mengyi,SUN Xiang,HUANG Luoyi, et al. Theoretical study on the structure and properties of Remdesivir and its synthetic intermediates[J]. JOURNAL OF WEZHOU MEDICAL UNIVERSITY, 2021, 51(9): 689-698.
摘要 目的：研究具广谱抗病毒活性的潜在治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的瑞德西韦及其合成中间体结构与性质之间的关系。方法：采用密度泛函理论方法X3LYP/6-311+G（2d，p）对瑞德西韦及其合成中间体13种化合物的分子结构、反应活性位点（分子表面静电势、原子电荷、前线分子轨道）和红外光谱进行分析，并运用概念密度泛函理论重点对化合物5和瑞德西韦（6a）的反应活性指数（化学势、化学硬度、亲电指数、亲核力差值指数和亲电力差值指数）差异比较，再利用药代动力学平台开展成药性评价。结果：几何结构分析化合物6a和12b，理论计算值和实验值基本吻合。分子静电势和原子电荷分析结果均表明，瑞德西韦及其中间体结构上的羟基氧易发生亲电反应，氨基氢和羟基氢易发生亲核反应。前线分子轨道分布说明鸟嘌呤类似物结构是瑞德西韦的活性母核结构，化合物5的活性优于瑞德西韦（6a）。药代动力学预测化合物2、9、12a和12b的成药性较好，并推测瑞德西韦（6a）可能对COVID-19疗效甚微或基本无效。结论：化合物5具有潜在研究价值，瑞德西韦疗效有待进一步探索。
收稿日期: 2021-02-20
基金资助: 国家自然科学基金资助项目（21177098）；浙江省自然科学基金资助项目（LY16B070006）。
通讯作者:
王朝杰，副教授
E-mail: chjwang@wmu.edu.cn
作者简介 : 陈蒙仪，在职硕士生，Email：446190940@qq.com。
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