MAGE-A家族抗原共同B细胞表位预测分析
金劲激，丁玉杰，王冰冰，侯柏龙，张丽芳，朱冠保
温州医科大学附属第一医院 胃肠外科,浙江温州,325000 温州医科大学 分子病毒与免疫研究所,浙江温州,325035
Comprehensive mapping of common immunodominant B-cell epitopes of MAGE-A subfamily
JIN Jinji，DING Yujie，WANG Bingbing，HOU Bolong，ZHANG Lifang，ZHU Guanbao
引用本文:
金劲激,丁玉杰,王冰冰,等. MAGE-A家族抗原共同B细胞表位预测分析[J]. 温州医科大学学报, 2013, 43(11): 706-710.
Cite this article:
JIN Jinji,DING Yujie,WANG Bingbing, et al. Comprehensive mapping of common immunodominant B-cell epitopes of MAGE-A subfamily[J]. JOURNAL OF WEZHOU MEDICAL UNIVERSITY, 2013, 43(11): 706-710.
摘要 目的:预测和筛选黑色素瘤抗原A(MAGE-A)家族抗原的共同B细胞表位.方法:以MAGE-A1的全长氨基酸序列为基础,利用生物信息学软件,采用Hopp&Woods的亲水性方案、Zimmerman极性参数和Jameson-Wolf抗原指数方案和Emini表面可及性方案等,结合MAGE-A1的二级结构与其柔性区域及跨膜区域对MAGE-A1的优势B表位区段进行综合分析,进一步运用抗原指数分析预测MAGE-A1的B细胞表位,并将其与MAGE-A家族中其他成员(MAGE-A2至A12)进行比对,以预测MAGE-A家族抗原的共同B细胞表位.结果:MAGE-A1的全长为309个氨基酸,相对分子质量为46 kDa,为可溶性蛋白.经综合分析,其B细胞优势表位可能存在于氨基酸序列N端的9～14,84 ～ 88,118 ～124,160 ～ 165,208 ～ 214,233 ～ 240区段;经与MAGE-A家族中其他成员的氨基酸序列比对,MAGE-A1的9～14,84 ～ 88,118～ 124及233 ～240区段,即HCKPEE,EEEGP,RAREPVTK,GEPRKLLT肽段可能为MAGE-A家族抗原共同B细胞优势表位.结论:利用生物信息学预测发现MAGE-A1的优势B细胞表位中,9～ 14,84 ～ 88,118 ～ 124及233 ～ 240区段可能为MAGE-A家族抗原的共同B细胞表位,可为表位疫苗的研制等提供理论依据。
基金资助: 浙江省自然科学基金资助项目
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